データベース構築で食生活や病気との関わりを明らかに

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2022-12-01

life_sciences_medicine

{'items': [{'key': '1tf7d', 'term': '腸内微生物叢', 'description': {'blocks': [{'key': 'enhim', 'text': '宿主であるヒトや動物と共生関係にある多種多様な腸内微生物の集まり。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'ain49', 'term': '微生物叢シークエンス', 'description': {'blocks': [{'key': 'dio3u', 'text': '微生物の全ゲノムDNAを短いDNA鎖に切断してライブラリを作成し、次世代シークエンサーによって配列決定する手法。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '88cak', 'term': 'crAss-like phage', 'description': {'blocks': [{'key': 'c8dnv', 'text': 'バクテリオファージの分類の一つで科レベル相当と考えられている。2014年にヒトの腸内細菌叢メタゲノムデータから再構築され、発見された。ヒトの腸内における主要なバクテリオファージの1つ。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'am2sg', 'term': '関節リウマチ', 'description': {'blocks': [{'key': '40v9p', 'text': '自己免疫疾患の1つで、関節に炎症が起き、骨が破壊されて、放っておくと関節が変形してしまう病気。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '9ah5g', 'term': '全身性エリテマトーデス', 'description': {'blocks': [{'key': '3cr4', 'text': '自己免疫疾患の1つで、自己抗体の産生や、腎臓・皮膚・脳神経・心臓などに起きる多様な臓器障害を特徴とする病気。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '6vdns', 'term': '炎症性腸疾患', 'description': {'blocks': [{'key': 'arv4j', 'text': '自己免疫疾患の1つで、自分の免疫細胞が腸の細胞を攻撃してしまうことで腸に炎症を起こす病気。潰瘍性大腸炎やクローン病を含む。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '1bjvv', 'term': 'metagenome assembled genome：MAG', 'description': {'blocks': [{'key': '2kv6g', 'text': '腸内微生物叢シークエンス情報から、再構築した微生物由来ゲノムの総称。腸内微生物叢シークエンシングによって得られた短いゲノム配列情報をつなぎ合わせたり、グループ化したりすることによって、個々の微生物のゲノムを再構築することができる。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '7pr6a', 'term': '納豆菌', 'description': {'blocks': [{'key': 'bl7of', 'text': '納豆の製造に必要な細菌。枯草菌の一種で学名はBacillus subtilis var. natto。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [{'offset': 22, 'length': 28, 'style': 'ITALIC'}], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '2t5pk', 'term': 'β-porphyranase', 'description': {'blocks': [{'key': '96tb', 'text': '紅藻（アマノリ属の一部で食用の海苔の原料の1つ）に含まれる硫酸化炭水化物であるポルフィランを分解する酵素。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '9ervc', 'term': 'rs671', 'description': {'blocks': [{'key': 'b50dr', 'text': 'アルコールの代謝に関わる遺伝子(ALDH2)中に存在する遺伝子多型、つまり個人間でのゲノム配列の違い。東アジア人集団に特異的に存在することが知られている。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'fjgdu', 'term': 'CRISPR', 'description': {'blocks': [{'key': 'ecrgi', 'text': '原核生物が持つファージやプラスミドに対する獲得免疫機構の1つ。侵入してきたファージやプラスミドのDNA配列の一部をスペーサーとしてCRISPR領域に取り組み、免疫記憶として利用する。本研究においては、CRISPR領域中のスペーサー配列とウイルス配列との相同性を調べることにより、細菌がどの様なウイルスに感染したのかを見出した。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}]}

['med']

['友藤嘉彦', '岡田随象']

本研究では日本人集団の腸内微生物ゲノムデータベースを再構築することに成功しました。我々の構築したデータベースが、世界中の多くの研究者たちに利用され、医学・生物学研究の今後の発展に貢献できることを、心より願っております。本研究は大阪大学医学部附属病院や関連施設より提供していただいたサンプルを用いることで達成することができました。全ての共同研究者や研究支援機構、並びにサンプルを提供してくださった方々に深く感謝を申し上げます。（大学院生・友藤嘉彦さん）

岡田随象

教授

医学系研究科

https://rd.iai.osaka-u.ac.jp/ja/baea0abff789d40f.html?k=%E5%B2%A1%E7%94%B0%E9%9A%8F%E8%B1%A1