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シングルセル高精度比較解析アルゴリズムを開発
大阪大学大学院医学系研究科の加藤有己准教授、大学院生の杉原礼一(博士課程)(神経遺伝子学)らの研究グループは、様々な経過時間の細胞が含まれる遺伝子発現データセットのペアに対し、疑似的な時系列 (疑似時間) に沿って分岐を含めてシングルセル比較解析を行う計算手法CAPITALを開発しました(図1)。 ...
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2022
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ヒト大腸がん組織に棲む記憶T細胞の機構を解明
大阪大学大学院医学系研究科の石井秀始 特任教授(常勤)、原知明 特任助教(常勤)(疾患データサイエンス学)と江口英利 教授、土岐祐一郎 教授(消化器外科学)らの研究グループは、現在国内外で利用可能な大腸がん組織に浸潤している免疫担当細胞のシングルセル解析を行うことによって、がん組織に入り込んで免疫記憶や抗がん作用に関...
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2023
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日本人集団初の免疫細胞シングルセルアトラスの創生
大阪大学大学院医学系研究科の枝廣龍哉助教(遺伝統計学/呼吸器・免疫内科学/理化学研究所生命医科学研究センター システム遺伝学チーム 客員研究員)、佐藤豪さん(当時:博士課程、現在:東京大学大学院医学系研究科 遺伝情報学 助教/理化学研究所生命医科学研究センター ...
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2025
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“血液一滴”でCOVID-19難治化を予測!
大阪大学免疫学フロンティア研究センターの川﨑貴裕 特任助教(常勤)(感染病態)と大阪大学大学院医学系研究科の武田吉人 准教授(呼吸器・免疫内科学)らの研究グループは、COVID-19において、MACROH2A1を新規の難治化予測バイオマーカーとして同定しました。 ...
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2022
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免疫細胞の複雑な個体差を捉える
新型コロナ感染症で重症化する患者とそうでない患者がいるのはなぜか、多くの人が疑問を抱いた。感染症総合教育研究 拠点(CiDER)において「ヒト生体防御学チーム」を率いるジェームズ・ウイング教授は、新型コロナなど重症感染症に ...
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究みのStoryZ
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2026
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免疫疾患シングルセル解析の羅針盤的総説を発表
大阪大学大学院医学系研究科 西出真之助教、大阪大学医学部附属病院 島上洋医員、大学院医学系研究科 熊ノ郷淳教授(呼吸器・免疫内科学)のグループは、シングルセルRNAシーケンス(scRNA-seq)を用いた自己免疫・アレルギー性疾患に関するこれまでの研究成果をまとめ、臨床応用への視点から解説した総説論文を発表しました。 ...
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2024
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肝臓のうっ血が肝臓病を引き起こす仕組みを解明
大阪大学大学院医学系研究科消化器内科学大学院生の加藤聖也さん(研究当時:博士後期課程、現在:大阪大学医学部附属病院医員)、疋田隼人講師らの研究グループは、小児心臓手術(フォンタン手術)後などに起こる肝臓のうっ血が肝線維化や肝臓がん発症に至るメカニズムとして、肝類洞内皮細胞のYAPの活性化やCTGFの発現が重要であること...
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2026
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COVID-19重症化における自然免疫細胞の関わりを明らかに
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2023