シングルセル情報とゲノム情報の統合解析

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2023-04-25

life_sciences_medicine

{'items': [{'key': '5vtc6', 'term': 'COVID-19', 'description': {'blocks': [{'key': 'fmtev', 'text': 'Coronavirus disease 2019（2019年に発生した新型コロナウイルス感染症）を略した言葉で、新型コロナウイルスによる病気のことを表す。2019年の終わり頃に、中国・武漢を中心に発生したのを皮切りに、その後、世界中に感染が拡大した。新型コロナウイルスに感染すると、発熱や咳、息苦しさといった症状が出て、感染が肺に及び肺炎を発症すると呼吸困難に陥る。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '62jeu', 'term': '末梢血単核細胞（PBMC)', 'description': {'blocks': [{'key': 'aoiog', 'text': '末梢血から分離された単核細胞成分のこと。単球やリンパ球といった免疫細胞から構成される。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'cd7um', 'term': 'シングルセル解析', 'description': {'blocks': [{'key': '9gddo', 'text': 'ひとつひとつの単一細胞から網羅的な手法を用いて、mRNA発現や細胞表面マーカー発現など、さまざまなデータを得ることのできる新規技術。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'bgdr1', 'term': '宿主', 'description': {'blocks': [{'key': 'dfchr', 'text': 'ウイルスや細菌類が、寄生または共生する相手の生物。本研究においてはヒト。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'd63in', 'term': '単球', 'description': {'blocks': [{'key': 'e06eb', 'text': '末梢血単核細胞の中の一種で、感染に対する防衛の開始に重要な細胞。食作用、抗原提示、およびサイトカイン産生などの役割を担う。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '8qkrj', 'term': 'CD14+CD16++単球', 'description': {'blocks': [{'key': 'a9dlr', 'text': 'ヒト末梢血単球集団は CD14と CD16の発現により3つの異なるサブセットに定義されるが、その中の一つ。Non-classical monocytesとも呼ばれる。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '4tj58', 'term': 'ゲノムワイド関連解析（GWAS）', 'description': {'blocks': [{'key': '6369d', 'text': 'genome-wide association study､遺伝子多型と形質（疾患の有無などを含む、個々人の性質や特徴）との関連を、ゲノム全域にわたって網羅的に探索する解析。現在の一般的なGWASでは、ゲノム全域で数百～数千万に及ぶ遺伝子多型が解析に用いられる。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '8dptf', 'term': '樹状細胞', 'description': {'blocks': [{'key': '26v51', 'text': '自然免疫細胞の一つで、リンパ球に抗原を提示し抗原特異的なリンパ球を活性化する代表的な抗原提示細胞。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '8dak7', 'term': '自然免疫', 'description': {'blocks': [{'key': '9pbvp', 'text': '侵入してきた病原体や異常になった自己の細胞をいち早く感知し、それを排除する仕組みであり、免疫反応の初期応答として好中球やマクロファージなどの「微生物などの異物を食べる細胞」が中心的な役割を果たす。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'bbu67', 'term': 'SARS-CoV-2', 'description': {'blocks': [{'key': '94uq7', 'text': '新型コロナウイルス感染症の原因となるウイルス。2002年に流行したSARSコロナウイルスとウイルスが似ているため、SARS-CoV-2と命名された。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '7ssn4', 'term': '遺伝子多型', 'description': {'blocks': [{'key': '3rqq1', 'text': 'ヒトゲノム配列を構成しているDNAの配列の個体差であり、集団中に1%以上の頻度で存在するものと定義されることが多い。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '5n2rr', 'term': 'eQTL（expression quantitative trait loci）', 'description': {'blocks': [{'key': '8fuc6', 'text': '遺伝子発現量の個人差と関連するゲノム領域。このような遺伝子発現量に対する遺伝子多型の影響をeQTL効果と呼ぶ。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '8evsr', 'term': 'トランスクリプトーム解析', 'description': {'blocks': [{'key': '6ol5g', 'text': 'RNAをシークエンスすることで、遺伝子発現を網羅的に定量する手法。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '8rcka', 'term': 'インターフェロン', 'description': {'blocks': [{'key': 'ammkt', 'text': 'ウイルス感染に際して生体内でリンパ球などから産生され、分泌されるサイトカイン。抗ウイルス作用、細胞増殖抑制作用、免疫調整作用などの生物活性を持つ。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}]}

['med']

['枝廣龍哉', '白井雄也', '熊ノ郷淳', '岡田随象']

シングルセル情報と宿主ゲノム情報を統合解析することにより、日本人集団におけるCOVID-19重症化メカニズムについて新たな知見を得ることができました。本研究の成果が、世界中の多くの研究者たちに利用され、COVID-19のみならず、医学・生物学研究の今後の発展に貢献できることを、心より願っております。本研究は遺伝統計学、呼吸器・免疫内科学が中心となり、免疫学フロンティア研究センターの複数の教室と共同研究を行うことにより達成することができました。全ての共同研究者や研究支援機構とともに、最前線で治療にあたっている医療スタッフ、検体をご提供していただいた方々に深く感謝を申し上げます。（枝廣龍哉さん）

岡田随象

教授

医学系研究科

https://rd.iai.osaka-u.ac.jp/ja/baea0abff789d40f.html?k=%E5%B2%A1%E7%94%B0%E9%9A%8F%E8%B1%A1