メタゲノムショットガンシーケンスによる腸内微生物叢の網羅的解析

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2021-08-25

life_sciences_medicine

{'items': [{'key': '7gtg1', 'term': '腸内微生物叢', 'description': {'blocks': [{'key': '1jh76', 'text': ' 宿主であるヒトや動物と共生関係にある多種多様な腸内微生物の集まり。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '51ajk', 'term': 'メタゲノム', 'description': {'blocks': [{'key': '5re52', 'text': ' 群集を構成する微生物のゲノムの総和。各微生物の単離・培養を行わず、集団から直接収集・抽出される。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '63bvq', 'term': '次世代シーケンサー', 'description': {'blocks': [{'key': 'd5vt9', 'text': ' 数千から数百万ものDNA分子を同時に配列決定するシーケンシング機器。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'asud7', 'term': 'ショットガンシーケンス', 'description': {'blocks': [{'key': 'dt0h1', 'text': ' 微生物の全ゲノムDNAを短いDNA鎖に切断してライブラリを作成し、次世代シーケンサーによって配列決定する手法。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '9bpni', 'term': 'パスウェイ', 'description': {'blocks': [{'key': '6441p', 'text': ' 遺伝子やタンパク質の相互作用、細胞内の連鎖的な化学反応など、生体内における様々なネットワークを示す経路。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'eqbt6', 'term': '質量分析計', 'description': {'blocks': [{'key': 'cm7lj', 'text': ' 物質の質量を測定する装置。血中代謝物の種類や量についての情報を取得することができる。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '5pu18', 'term': '関節リウマチ', 'description': {'blocks': [{'key': 'bt118', 'text': ' 自己免疫疾患の1つで、関節に炎症が起き、骨が破壊されて、放っておくと関節が変形してしまう病気。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'alhur', 'term': 'バイオインフォマティクス', 'description': {'blocks': [{'key': '3b95a', 'text': ' 生命科学と情報科学の融合分野のひとつであり、情報科学や統計学などのアルゴリズムを用いた方法論やソフトウェアを活用して生命現象を解き明かすことを目的とする。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'dve4n', 'term': '炎症性腸疾患', 'description': {'blocks': [{'key': '6a639', 'text': ' 自己免疫疾患の1つで、自分の免疫細胞が腸の細胞を攻撃してしまうことで腸に炎症を起こす病気。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'dtphu', 'term': '鞭毛', 'description': {'blocks': [{'key': 'bgtp7', 'text': ' ある種の細菌などにみられる、細長い突起状をした運動性の細胞小器官。免疫応答を引き起こすことが報告されている。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'clc62', 'term': 'ゲノムワイド関連解析', 'description': {'blocks': [{'key': '1os8r', 'text': ' ヒトゲノム配列上に存在する数百万カ所の遺伝子変異を網羅的にタイピングし、疾患や形質との関連を網羅的に探索する手法。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '2q2hs', 'term': 'アシルカルニチン', 'description': {'blocks': [{'key': '1pjtk', 'text': ' 脂肪酸とカルニチンが結合して生成する化合物。炎症との関連が報告されている。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '49060', 'term': 'バイオマーカー', 'description': {'blocks': [{'key': 'b7l3p', 'text': ' タンパク質や遺伝子などの生体内の物質で、病状の変化や治療の効果の指標となるもの。 ', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}]}

['med']

['友藤嘉彦', '前田悠一', '猪頭英里', '岡田随象']

本研究ではメタゲノムショットガンシーケンスを行うことで、腸内微生物叢と全身性エリテマトーデスとの関連を網羅的に探索・同定することに成功しました。我々の研究が、全身性エリテマトーデスの病態解明に貢献し、より良い治療法の開発に繋がることを心より願っております。本研究は大阪大学医学部附属病院や関連施設より提供していただいたサンプルを用いることで達成することができました。全ての共同研究者や研究支援機構、並びにサンプルを提供してくださった方々に深く感謝を申し上げます。（友藤嘉彦さん）

岡田随象

教授

医学系研究科

https://rd.iai.osaka-u.ac.jp/ja/baea0abff789d40f.html?k=%E5%B2%A1%E7%94%B0%E9%9A%8F%E8%B1%A1