タンパク質がDNAに触れた履歴を残す新技術

<plone.namedfile.file.NamedBlobImage object at 0x7fedfffa1200 oid 0x659888 in <Connection at 7fee2c093eb0>>

2024-11-19

natural_sciences

{'items': [{'key': 'ctv58', 'term': '非標準DNA', 'description': {'blocks': [{'key': '1gaab', 'text': '従来DNAは塩基対形成に基づく二重らせん構造を形成しますが、二重らせん構造以外の高次構造を形成することがあり、これを非標準DNAと言います。よく見られる非標準DNAの例として、グアニンおよびシトシンが豊富なDNA配列でそれぞれ形成されるグアニン四重鎖（G-quadruplex, G4）やシトシン四重鎖（intercalated motif, i-motif）が挙げられます。これら非標準DNAはテロメア領域やタンパク質をコードする遺伝子のプロモーター領域など、ゲノムの重要な領域に多く見られ、細胞内プロセスへの関与が注目されています。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '80drk', 'term': '指紋標的濃縮法', 'description': {'blocks': [{'key': '8m278', 'text': '目的のDNA配列に、反応性の高いリンカーを介して炭素-炭素三重結合（アルキン）を有する部位を導入した化学修飾DNAを調製し、これをタンパク質の化学修飾に用います。化学修飾DNAに対してタンパク質が結合もしくは近接すると、タンパク質中のアミノ酸側鎖がDNA上の反応性リンカーと反応し、一定の割合でアルキンがタンパク質側へ移動します。つまり、タンパク質上のアルキンの存在はDNAに近付いたという”指紋”となります。この指紋の存在を目印として追加の化学反応を行い、磁気ビーズを用いて選択的に濃縮して質量分析測定に供することで、特定のDNAに結合・近接したタンパク質群を網羅的に同定します。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '4h5gc', 'term': '核小体', 'description': {'blocks': [{'key': 'bhnfm', 'text': '細胞の核内に存在する球状の構造体であり、タンパク質合成装置であるリボソームの生合成が主に行われています。中にはリボソームDNAが格納されており、これが活発に転写され、リボソーム生合成に必要なリボソームRNAが供給されます。これらを通じて、細胞の成長やタンパク質の合成に重要な役割を果たしています。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}]}

['es']

['山元淳平', '伴 勇輝']

本研究にて開発した指紋標的濃縮法は非標準DNA構造に限らず、さまざまな核酸に対して使用できるポテンシャルがあります。現在、疾患関連核酸構造に結合する因子の探索を行なっており、疾患の分子機構解明を通じて生命科学の発展に貢献したいと考えています。また、細胞内や生体内で本手法が適用できれば、昨今隆盛なゲノム編集技術や核酸医薬の作用機序解明につながる可能性もあり、今後創薬への応用展開を期待しています。

山元淳平

准教授

基礎工学研究科

https://rd.iai.osaka-u.ac.jp/ja/3767f0c02246eac7.html