大阪大学が世界の蛋白質構造データバンク（PDB）を運営して20年

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2023-05-11

natural_sciences

{'items': [{'key': '9p37e', 'term': '日本蛋白質構造データバンク（Protein Data Bank Japan: PDBj）', 'description': {'blocks': [{'key': 'dqm8u', 'text': '日本蛋白質構造データバンク（PDBj: Protein Data Bank Japan）は、2000年に大阪大学蛋白質研究所に共同利用・共同研究拠点活動を担う組織として設置されました。20年にわたりアジア・中東地区からのタンパク質や核酸の立体構造情報を収集・編集・登録し、米国RCSB、BMRBおよび欧州 PDBeと協力して、国際的に統一化された一つの蛋白質構造データベース（PDB）として全データを大阪大学から世界に発信しています。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '6om6t', 'term': '蛋白質構造データベース（Protein Data Bank : PDB） ', 'description': {'blocks': [{'key': '6u978', 'text': '蛋白質立体構造データベース（Protein Data Bank：PDB）は実験的に決定した生体高分子の３次元構造を保存する世界で唯一のデータベースです。1971年に米国で7つのエントリーからスタートしました。90年代後半になり、登録件数が全世界的に増加したことに伴って、日本には日本蛋白質構造データバンク（PDBj）が、欧州にはProtein Data Bank in Europe（PDBe）が設置されて、国際連携でPDBを維持・管理するようになりました。現在の総登録件数は20万件以上で、毎週250件程度の新規構造が追加されています。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '9ffg2', 'term': '国際蛋白質構造データバンク（worldwide Protein Data Bank : wwPDB）', 'description': {'blocks': [{'key': 'c5qdh', 'text': '大阪大学蛋白質研究所に加えて、米国ラトガース大学とカリフォルニア大学サンディエゴ校の共同研究チーム(RCSB PDB)とNMRの実験データを収録するコネチカット大学、欧州はイギリスにある欧州生物情報科学研究所(EMBL-EBI)がメンバーとなって共同でPDBデータの登録・維持・管理を行う国際プロジェクト。2003年に正式な協定が結ばれて設立された。日本蛋白質構造データバンク（Protein Data Bank Japan: PDBj）はwwPDBの設立メンバーであり、アジア・中東地区からのデータ処理・登録に責任を負っている。2022年に中国・上海にある国立蛋白質研究施設が准メンバーとして加わり、PDBjの指導の下で編集業務を一部分担している。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}]}

['protein']

['栗栖源嗣']

国際的なデータベースの構築拠点が国内にあり、国際的に広く認知されている利点を生かして、正確で使いやすい情報を日本語（中国語，韓国語）で迅速に提供します。節目の年を迎えて生命科学研究の情報基盤を提供する組織として、より一層の国際連携とデータ高度化を進めてまいります。

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栗栖源嗣

教授

蛋白質研究所

https://rd.iai.osaka-u.ac.jp/ja/908b2899e6d6c66d.html?k=%E6%A0%97%E6%A0%96%E6%BA%90%E5%97%A3