クラウドコンピューティングを利用した迅速診断に期待

<plone.namedfile.file.NamedBlobImage object at 0x7fedf9282dd0 oid 0x42a3c5 in <Connection at 7fee02bc1a60>>

2023-03-27

life_sciences_medicine

{'items': [{'key': 'e5f92', 'term': '次世代シーケンシング技術', 'description': {'blocks': [{'key': '1il4k', 'text': '全ての生物が持つゲノムDNAはA（アデニン）、T（チミン）、G（グアニン）、C（シトシン）の4種類の塩基が連なった構造をしています。DNAの塩基配列を解読することはシーケンシングと呼ばれ、近年の技術革新が可能とした多量の塩基配列の同時解読技術を、特に次世代シーケンシング技術と呼びます。本研究においてはOxford Nanopore Technologies社のMinIONというポケットサイズの超小型次世代シーケンサーを用いることで、より臨床現場での使用を容易にしました。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': 'cbq7e', 'term': '非結核性抗酸菌（NTM; Non-Tuberculous Mycobacteria）', 'description': {'blocks': [{'key': 'ahpsc', 'text': 'マイコバクテリウム属細菌はグラム陽性細菌に分類される真正細菌の一属で、結核菌など約200種が登録されています。このマイコバクテリウム属の細菌は抗酸菌と総称され、そのうち結核菌群および、らい菌を除いた細菌を非結核性抗酸菌（NTM）といいます。これらにより引き起こされる感染症はNTM症と呼ばれ、免疫不全患者だけでなく健常者へも感染し、感染後は自覚的な症状がほとんど無いまま長い時間をかけて病状が進行します。発症後は咳・痰・血痰・発熱・食欲不振・体重減少・全身倦怠感などが見られ、抗生物質も効きづらいため、長期の適切な薬剤治療が必要となる難治性の病気です。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '4gu1a', 'term': '亜種レベル', 'description': {'blocks': [{'key': '2kokv', 'text': '生物の分類区分で、種の下位区分。非結核性抗酸菌症の主要な病原菌であるMycobacterium aviumの亜種であるhominissuis、silvaticum、paratuberculosisなど、近年次々と亜種が発見されています。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '6vh12', 'term': 'MGIT', 'description': {'blocks': [{'key': '6kqcq', 'text': 'Mycobacteria Growth Indicator Tube法で頭文字を取ってＭＧＩＴと呼ばれている液体培養の手法。小川培地法では、菌の発育に4～8 週を要するのに対して、液体培地法（MGIT）では菌の発育は迅速で2-4週程度で検出でき、また、検出感度も小川培地に勝っている。培養陽性検体で，小川培地と液体培地(MGIT培地)で培養陽性日数を比較すると，平均で約10日速くなる。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}, {'key': '4th0p', 'term': 'NTM175種を網羅した大規模ゲノムデータベース', 'description': {'blocks': [{'key': '76jj5', 'text': 'データベースに登録された配列と同定したい検体の配列を照合することによりマッチする菌種を探す手法はsequence typingと呼ばれ、それを複数遺伝子に拡張したものが Multi-Locus Sequence Typing と呼ばれます。菌種固有の遺伝子のDNA配列をデータベースに登録しておくことで極めて高い精度で同定が行え、データベースの規模が大きいほど検出能力が上昇します。今回、本研究においてはリボソーム分子の構成に関わる遺伝子やNTMの抗生物質耐性に関わると考えられている184遺伝子を選んだ上で、公共データベースおよび我々が新規に解読した計175種のNTMのゲノム情報を用いることで、マイコバクテリウム同定のための独自のデータベースを作成しました。', 'type': 'unstyled', 'depth': 0, 'inlineStyleRanges': [], 'entityRanges': [], 'data': {}}], 'entityMap': {}}}]}

['ifrec']

['福島清春', '松本悠希', '中村昇太']

NTMは身近な水場や土壌にも生息している環境菌であるにもかかわらず、ひとたび感染し発症・進行してしまうと治療が難しく、完治まで非常に長い時間がかかることが知られています。本研究の成果の応用がNTM症の早期発見・治療に役立てられるとともに、未だ不明な点の多いNTM症の病態解明の一助となり、患者の皆様に生かされることを期待しています。

福島清春

特任助教（常勤）

免疫学フロンティア研究センター

https://rd.iai.osaka-u.ac.jp/ja/53f7a67d98ca753a.html?k=%E7%A6%8F%E5%B3%B6%E6%B8%85%E6%98%A5